1998年邓朴方在中国残疾人福利基金会第十四次理事会上提出解放思想，转变观念，充实基金会工作力量，充分发挥理事作用，积极探索，开拓基金会工作新局面。
1999年5月12日，邓朴方在中国残疾人福利基金会第十五次理事会上提出：基金会作为一个专门的基金募集和管理机构，要独立开展工作；研究推出一些受益面广、效益好、具有一定社会影响的募捐项目，开展主题募捐；加强与地方残疾人福利基金会的协作，发挥中央与地方两个积极性，加强面向企业的重点劝募。
2002年7月25日，中国残疾人福利基金会第十八次理事会议上,邓朴方会长明确提出二次创业的目标：弘扬人道主义精神，创造和传播公益文化；改革基金会组织架构，巩固和扩大基金会的社会基础；完善基金会业务格局，健全基金募集、增值和使用管理制度；探索社会化的工作方式；加强自律，维护和提高社会公信力；加强对地方基金会工作的指导，开展国际合作与交流；培养知识化、专业化、全心全意为残疾人服务的基金工作者队伍。
邓朴方、江上舟为中国残疾人福利基金会新址揭幕
邓朴方与刘雪冬在揭幕仪式上
2006年3月15日，在中国残疾人福利基金会二届一次理事会上，邓朴方被推举为会长，江上舟为理事长。邓朴方作了题为《为建设一个公开、透明、高效率和高公信力的世界一流基金会而奋斗》的重要讲话，指出：中国残疾人福利基金会和中国残疾人联合会犹如车之两轮，鸟之两翼，都是残疾人事业的重要推动力量。
2009年4月18日，中国残疾人福利基金会二届九次理事会上汤小泉当选为理事长。
2010年4月23日，邓朴方会长在中国残疾人福利基金会第二届理事会第十次会议上做出重要指示：基金会要在第三次社会分配体系中发挥应有的作用，要不断增加捐款渠道，努力扩大捐赠社会面，要把基金会与人民群众和青少年联系起来，充分履行公募基金会的社会责任。
2011年6月12日，中国残疾人福利基金会召开换届大会，产生新一届理事会。三届一次理事会推举邓朴方为会长，选举汤小泉为理事长。大会通过了《向第二届理事会名誉理事长、名誉理事、理事、特邀理事的致敬信》。
